新疆財經大學財政稅務學院具有70余年的發展歷史，設置的財政學、稅收學專業是新疆高校最早布點專業。1959年財政學專業開始招收本科生，1981年恢復本科建制，1998年獲批財政學碩士學位點，2011年獲批稅務碩士專業學位點，2018年獲批財政學博士學位點，形成了涵蓋本－碩－博完整的人才培養體系。學院目前設立財政和稅收2個專業教學系，1個創新與實驗中心。主要建設財政學、稅收學兩個本科專業。其中財政學專業2019年獲批國家一流本科專業建設點，稅收學專業2021年獲批自治區一流本科專業建設點。
    學院與中國人民大學財政金融學院、中央財經大學財政稅務學院、上海財經大學公共經濟與管理學院等內地知名高校建立了長期的對口援助關系，與中央財經大學聯合培養財政學專業本科生。擁有1個智慧財稅模擬實驗室，19家政產教融合基地，其中自治區財政廳、自治區稅務局為自治區級產學研聯合培養基地。擁有1個自治區人文社科基地“新疆財政金融協同創新中心”。《財政學》《國家稅收》2門課程獲批自治區一流課程。