香港大學深圳醫院是由深圳市政府全額投資、并引進香港大學現代化管理模式和先進醫療技術的大型三甲綜合性公立醫院。
醫院于2012年7月1日起運營，2018年6月，醫院入選廣東省首批高水平醫院建設培育單位；2021年入選國家公立醫院高質量發展試點醫院，重點發展高水平臨床重點專科和前沿科技創新，開展卡脖子技術研究。
依托香港大學雄厚的科研力量和一流的導師隊伍，醫院現建有1個廣東省工程技術研究中心、3個深圳市醫學重點實驗室、2個深圳市工程實驗室、1個深圳市公共服務平臺，現有實驗場地面積約3000平方米，河套深港科技創新合作區轉化研究中心將于2022年建成投入使用。
醫院引進愛丁堡大學、多倫多大學、瑞典卡羅林斯卡醫學院、香港大學等 “三名工程”高層次醫學團隊11個，全職引進腫瘤方向、生殖醫學方向深圳市孔雀科研團隊2個。迄今為止，共獲得國家、省、市科研項目287項，科研經費累計3.5億余元。