廈門醫學院是一所全日制公辦普通本科高校，是福建省三所醫學類本科高校之一，也是閩西南唯一的醫學類本科高校。辦學淵源可追溯到1898年在鼓浪嶼設立的廈門醫學專門學校。學校傳承“德厚立人、術湛立業”的校訓，凝練并弘揚“陽光、大氣、善良、感恩”的校風和“忠誠、團結、實干、創新”的學風，以培養“對國家盡忠、對父母盡孝、對單位盡責、對患者盡心”的“四盡”醫學人才為目標，立足廈門、面向福建、輻射全國，致力于為醫療衛生行業、生物醫藥和健康服務產業輸送高素質應用型醫藥衛生人才。
學校位于被譽為“高素質的創新創業之城、高顏值的生態花園之城”的現代化國際化城市——廈門經濟特區，依山傍海，環境優美，教學和科研設備先進，公共服務和管理體系完備，生態校園、智慧校園和文明校園建設成果顯著。校園占地520畝，二期規劃用地365畝，目前總建筑面積22萬平方米，教學科研儀器設備總值近3.4億元，圖書館藏書近65.9萬冊，電子圖書達56萬種。學校師生數已達萬人。
師資人才隊伍不斷壯大。現有教職醫護員工2778人（含2所直屬附屬醫院）。其中，專任教師420人，有博士學位119人，碩士學位244人，占專任教師總數的86.4%;有正高職稱81人，副高職稱144人，占專任教師總數的53.6%；另有外請教師1400余人。學校聘請著名呼吸病學專家、中國工程院鐘南山院士為呼吸疾病研究所名譽所長、附屬第二醫院名譽院長。學校共有47人獲得國務院政府特殊津貼、新世紀百千萬人才工程國家級人選、“教育部新世紀優秀人才支持計劃”入選者、省百千萬工程領軍人才、省引進臺灣高層次人才“百人計劃”入選者、省百千萬人才工程省級人選、省五一勞動獎章獲得者、省教學名師、省級優秀教師、省級青年教學名師、省級教壇新秀、省高校新世紀優秀人才支持計劃入選者、省高校杰出青年科研人才培育計劃入選者、廈門市“雙百計劃”引進海外高層次人才、廈門市杰出人才、廈門市本土領軍人才、廈門市拔尖人才、廈門市臺灣特聘專家、廈門市臺灣特聘專才、廈門市杰出青年、廈門市創新創業人才、廈門市高層次留學人員等人才和榮譽稱號。
教育教學改革扎實推進。先后獲得一批國家級、省市級教育教學榮譽和成果。國家級包括中央財政支持建設專業2個、實訓基地3個，全國健康服務類、養老服務類示范點各1個，國家行業職業教育教學指導委員會教學成果獎1項，主編國家級規劃教材6本。省級包括教學成果獎4項，本科教學團隊2個，一流專業建設點2個，省級立項建設專業12個，實驗教學中心9個，一流課程34門，精品（在線）課程11門，教育教學改革項目42項。市級重點專業5個。2018年以來，在第四、五屆全國本科高校青年教師教學競賽中獲二等獎2項；在2021年全國本科高校教師教學創新大賽中獲三等獎；在福建省第四、五屆本科高校青年教師教學競賽中，獲特等獎2項，一等獎1項，二等獎2項，三等獎1項；在2021年福建省首屆本科高校教師教學創新大賽中，獲一等獎1項、二等獎2項、專項獎3項，成為全省唯一包攬三項專項獎的學校；學校三度獲“最佳組織獎”。
科研創新能力全面提升。現有國家CMA認證的分析測試中心1個，省級科研平臺6個，市級科研平臺3個。2016年以來，學校承擔國家自然基金等各類科研立項646項，橫向課題72項；獲福建省科技進步獎、自然科學優秀學術論文獎及廈門市醫學創新獎等成果；授權國家發明專利等知識產權174項；發表自然社科類和社會科學類論文1856篇。
醫教協同發展深入推進。建有2個國家醫師資格考試（臨床類別和口腔類別）實踐技能考試基地，擁有2所直屬附屬醫院、3所非直屬附屬醫院、41所教學醫院和91個校外實訓基地。
